杂交筛选——cdna序列作为探针 whatman 3mm滤纸的应用
1.如上述将文库铺平板,噬菌斑杂交实验用e.coli宿主菌株y1088。
2.噬菌斑于42℃生长过夜。
3.从温箱取出平板,置4℃冷却至少1h。
4.膜剥离:首先,用软铅笔在干的硝酸纤维素滤膜上给准备影印的平板编号。其次,从平板的中央开始向边缘小心将滤膜铺在菌台上。当滤膜完全变湿后(颜色变灰),再等30s。同时,用针头在平板上标出滤膜的3个不对称位置。小心将滤膜从平板上剥离,接触面向上放在一张干净的whatman 3mm滤纸上。在进行下一步骤之前,所有的平板重复步骤4。
5.将滤膜接触面向上漂浮在变性液(0.5 mol/l naoh; 1.5 mol/lnacl)中5min。
6.中和5min。
7.用2×ssc洗涤5min。
8.将滤膜放在一张新的whatman3mm滤纸上,用铅箔将滤膜和滤纸一起包住。
9.在真空炉中80℃烘烤2h。
10.用6×ssc预先短暂地湿润滤膜,然后用预洗液(50 mmol/ltris-cl ph8.0; 1mol/l nacl; 1mmol/l edta; 0.1%sds)于68℃预洗涤至少1h。用一个盘子放在水浴摇床上。
11.将25张滤膜转移到一个装有50ml杂交液(5×sspe;1×denhardt’s液;100μg/ml ct-dna;0.1%sds)的贮存罐内(直径至少90mm),68℃预杂交2h。
12.对于每ml杂交液,2倍的105至1×106cpm的双链探针经沸水浴变性10min后,迅速放冰上冷却。
13.变性探针立即加到预杂交混合液中。
14.在封口的贮存罐内于68℃杂交过夜,不断地晃动以防滤膜粘在一起。
15.杂交结束后,滤膜用2×ssc,0.01%sds于室温洗涤3次约1h。
16.将潮湿(防止干燥)的硝酸纤维素滤膜放在一张硬纸或x光片上,用放射性墨水在针头标签上作标记。
17.滤膜用塑料包装袋(如saran)包住,然后加上增感屏在x光片上于-70℃曝光过夜。